Le principe de la laïcité de l'État est reconnu par la constitution, qui garantit la liberté de croyance et de culte.

La religion possède une importance culturelle et sociale considérable. 84% des Japonais sont de confession shintôïste ou bouddhiste, le plus souvent l'une et l'autre en même temps, les autres confessions représentent 16% de la population dont 0,7% de confession chrétienne.