L'extension en latitude du pays, de la zone tropicale à l'Antarctique, explique la diversité des climats. On distingue trois zones climatiques :
le nord est désertique et très aride mais la présence au large du courant froid de Humboldt et l'altitude modèrent les températures ;
le centre a un climat de type méditerranéen ; les hivers sont doux et les étés relativement frais ; les nuits sont très fraîches ;
le sud connaît un climat de type océanique, humide et froid.

Le Chili se trouvant dans l'hémisphère sud, les saisons y sont inversées par rapport à l'Europe. Dans la zone centrale, l'été débute fin décembre et s'achève fin mars. L'hiver, peu rigoureux, dure de juin à août.

Le nord connaît une absence totale de pluie. La pluviosité augmente en allant vers le sud. Les précipitations annuelles sont de 350 mm à Santiago, 5000 mm dans la zone du détroit de Magellan. De même les températures modérées à Santiago (de 10° en moyenne l'hiver à 28° l'été) ne cessent de chuter en descendant vers la Patagonie où la moyenne annuelle est de 6°.

La flore varie en fonction du climat : désertique au nord, composée de hêtres, cèdres, conifères, araucarias au centre et de steppes dans les régions australes.